基于区域感应卷积神经网络的细胞分割方法开题报告

 2022-08-28 11:40:13

全文总字数:8703字

1. 研究目的与意义(文献综述)

1.目的及意义(含国内外的研究现状分析)

1.1 目的及意义

图像分析在细胞生物学上有很好的应用,是在大图像集合上准确且自动化分析和量化相关生物学的关键,是各种医学图像应用的基础,其优势有时间空间上的精确性、快速性和灵敏性。从基于图像的分析到高内容筛选[1,2],显微镜图像已经开启了遗传扰动的理解、药物研究的探索、表型细胞在生物医学应用和细胞生物学上的研究[3,4]

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2. 研究的基本内容与方案

2.研究(设计)的基本内容、目标、拟采用的技术方案及措施

2.1 基本内容

1.在数据集BBBC022和Van Valen上训练和测试语义分割模型U-Net,观察分割错误(合并和拆分)的比例。其中数据集中50%的图像用于训练,25%用于验证,25%用于测试。

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3. 研究计划与安排

3.进度安排

时间节点

内容

2019年1月11日-2019年1月31日

阅读文献,主要是细胞分割和物体分割的相关的文献;

2019年2月1日-2019年2月28日

掌握技能,具有针对性的学习编程语言,算法,图像处理相关知识,实现基于区域感应卷积神经网络的目标检测算法,完成开题报告

2019年3月1日-2019年3月31日

细胞分割数据标注及训练

2019年4月1日-2019年4月30日

通过训练好的模型在测试数据集上进行测试分析

2019年5月1日-2019年6月

撰写毕业论文及准备答辩

4. 参考文献(12篇以上)

4.参考文献

1. Boutros, M., Heigwer, F. Laufer, C. Microscopy-Based High-Content Screening. Cell 163, 1314–1325 (2015).

2. Mattiazzi Usaj, M. et al.High-Content Screening for Quantitative Cell Biology. Trends Cell Biol. 26,598–611 (2016/8).

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