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1. 研究目的与意义(文献综述)
1.目的及意义(含国内外的研究现状分析)
1.1 目的及意义
图像分析在细胞生物学上有很好的应用,是在大图像集合上准确且自动化分析和量化相关生物学的关键,是各种医学图像应用的基础,其优势有时间空间上的精确性、快速性和灵敏性。从基于图像的分析到高内容筛选[1,2],显微镜图像已经开启了遗传扰动的理解、药物研究的探索、表型细胞在生物医学应用和细胞生物学上的研究[3,4]。
2. 研究的基本内容与方案
2.研究(设计)的基本内容、目标、拟采用的技术方案及措施
2.1 基本内容
1.在数据集BBBC022和Van Valen上训练和测试语义分割模型U-Net,观察分割错误(合并和拆分)的比例。其中数据集中50%的图像用于训练,25%用于验证,25%用于测试。
3. 研究计划与安排
3.进度安排
| 时间节点 | 内容 |
| 2019年1月11日-2019年1月31日 | 阅读文献,主要是细胞分割和物体分割的相关的文献; |
| 2019年2月1日-2019年2月28日 | 掌握技能,具有针对性的学习编程语言,算法,图像处理相关知识,实现基于区域感应卷积神经网络的目标检测算法,完成开题报告 |
| 2019年3月1日-2019年3月31日 | 细胞分割数据标注及训练 |
| 2019年4月1日-2019年4月30日 | 通过训练好的模型在测试数据集上进行测试分析 |
| 2019年5月1日-2019年6月 | 撰写毕业论文及准备答辩 |
4. 参考文献(12篇以上)
4.参考文献
1. Boutros, M., Heigwer, F. Laufer, C. Microscopy-Based High-Content Screening. Cell 163, 1314–1325 (2015).
2. Mattiazzi Usaj, M. et al.High-Content Screening for Quantitative Cell Biology. Trends Cell Biol. 26,598–611 (2016/8).
